案件引起了广泛的社会影响，公安机关的压力也是巨大的。可是，现场遭到围观群众的破坏，一点有价值的痕迹物证都没有能够发现，这就从源头上失去了破案的线索、甄别犯罪分子的依据和证据，侦查工作一时陷入了绝境。
省厅、市局组成了专家组，专门对这起案件进行了研究。
最初的希望还是在于被害人家的现场勘查。虽然距离尹家、周家的事件已经过去了十几天，但是专案组的现场勘查员还是对两家的门窗进行了细致的勘查，同时，也对初次勘查时候的照片、录像进行了审阅。
这两家的房屋都是简单的联排平房，出入口比较复杂。但是，据两家人阐述，他们睡觉的时候，都是关闭大门的。因为是酷热的夏天，所以为了节省空调电费，都是打开电风扇、打开窗户睡觉的，那么，犯罪分子进入现场的通道就只有可能是窗户。可是，经过勘查，窗户、窗柜和窗台上都没有可利用的痕迹。经过复勘，技术人员认为不仅仅是因为载体不好，因为就算载体不好，也会留下刮擦、攀爬的痕迹，可是两个现场都没有发现这些痕迹。换句话说，犯罪分子的出入口，无从判断。
犯罪分子从何处进入现场，一时也被群众传的是神乎其神，甚至妖怪、食人族、外星人什么的谣言都出来了。
另一组勘查员在聂之轩的带领下，对庄姓女婴家，以及抛尸路线进行了勘查。同样，庄姓女婴家唯一可能的进出口也是窗户，但是窗户却没有任何可疑的痕迹。聂之轩还对庄家的大门和围墙进行了勘查，大门的门锁很正常，没有撬压的痕迹，围墙也没有攀爬的痕迹。犯罪分子的出入口再次出现了无法分析的情况。
放弃了对庄家物证的搜索，聂之轩率队沿着各条路，从庄家到小学现场走了几趟。因为是在普通的镇子上，所以只要对镇子熟悉，很轻松就可以避过所有的监控，于是监控调查这条路也走不通了。好在细心的聂之轩记得，婴儿尸体的尸僵形成状态是蜷缩的，这说明婴儿死亡后，在尸体被运送的途中，应该处于一种蜷缩的体位。而无论是横抱、背负还是肩扛，尸体都不应该是蜷缩的，所以聂之轩认定女婴在运送途中，应该是被某种包裹物包裹。所以，在沿途搜索中，聂之轩一心想找到这个包裹物。
功夫不负有心人，这个包裹物还真的被聂之轩找到了。在几条路线上，聂之轩几乎是逢垃圾桶都要翻找一下。同事们不知道他的用意，心想这家伙是假肢，所以不怕脏吗？不过，当聂之轩从一个垃圾桶里拽出一条黄色的布的时候，大家终于意识到他的用心。
这是一条不知道作何用的布，上面有几个香烟烧灼的洞。经过多人辨认，一直没有找出这块布的主人。聂之轩把布送回市局物证鉴定中心进行物证提取，果真在布上寻找到了庄姓女婴的血迹，这应该是她头顶针眼渗出的少量血迹黏附在了布上。可惜，物证部门无法从布上再寻找到第二个人的DNA，唯一可能提取到直接指向犯罪分子证据的物证也没有了。不过，物证部门从布上提取到了一些油脂类成分，有动物油成分，也有植物油成分，因此分析这可能是一条餐桌布。
物证这条路又陷入绝境，专案组只有重新再坐下来研究犯罪分子的作案动机。
侵害婴儿的案件，作案动机无外乎几种：最常见的，就是父母伤害、杀害自己的孩子，可是，这三个案件来源于三个不同的家庭，因此排除。其次就是性侵、猥亵婴幼儿的案件，可是三起案件的被害人的性器官都没有遭受侵害的损伤痕迹，所以也不太像。再者就是拐卖婴儿，这三起案件显然也不是。还有一种可能就是和三名婴儿的父母有仇，这是复仇行为，可是经过警方长达一个月、访问人数超过千人的调查工作，确定这三个家庭之间不存在丝毫的联系，更没有什么共同的矛盾点，而且这个几万人的镇子上，家里有婴儿的家庭有不少，这三个受害人家庭应该都是被随机选择的，于是这一个动机也随即被排除。最后就是精神病伤人了，警方又花了一个月的时间，对镇子上所有精神病人，或者是有精神疾病症状的人都调查了一遍，可惜缺乏甄别依据，也无功而返了。
案件侦办工作，于是乎又失去了方向，还得考虑其他途径。
警方也曾经想围绕着银针的来源进行调查，可是经过专家的识别，这些银针就是很普通的中医用细针灸针，去掉了针柄而已，想要获取这样的银针，实属易事。但是警方抓住这一根救命稻草，仍然进行了一轮深入调查。对所有镇子上和中医有关的人，以及网购细针灸针到镇子附近的人，都进行了一番调查，以至于很多家里有银针的人，都将银针偷偷藏起，谎称没有，省去了被警方盘问的麻烦。
视频组也是巧妇难为无米之炊，镇子上的交通监控摄像探头少得可怜，民用摄像监控探头更是凤毛麟角。即便是获取有限的摄像探头的影像，也因为种种原因，并无价值。
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